Une étude dévoile de nouvelles stratégies de lutte contre les bactéries résistantes aux antibiotiques
Il y a plusieurs milliards d’années, une course aux armements génétiques a commencé entre les bactéries et leurs prédateurs viraux. Cette lutte est toujours d’actualité et a une incidence sur des maladies qui tuent chaque année des dizaines de milliers de personnes dans le monde.
Une étude récente publiée dans la revue se penche sur les effets des bactériophages (ou phages) – des virus qui tuent les bactéries – sur la gravité du choléra, maladie diarrhéique d’origine hydrique. Chaque année, le choléra tue entre 21 000 et 143 000 personnes dans le monde. Cette maladie est liée à la pauvreté : elle affecte les régions où l’approvisionnement en eau potable et les services d’assainissement sont déficients.
L’équipe, dont fait partie Jesse Shapiro, professeur de microbiologie et d’immunologie Ă l’UniversitĂ© 69ČČĘÓƵ, a menĂ© ce qu’elle estime ĂŞtre l’une des plus importantes Ă©tudes gĂ©nĂ©tiques consacrĂ©es Ă l’analyse de la relation dynamique entre la bactĂ©rie du cholĂ©ra, ses bactĂ©riophages et les antibiotiques.
ł˘â€™Ă©tłÜ»ĺ±đ fait ressortir la possibilitĂ© de crĂ©er de nouvelles stratĂ©gies reposant sur l’utilisation de bactĂ©riophages pour tuer des bactĂ©ries rĂ©sistantes aux antibiotiques prĂ©sentes dans le cholĂ©ra et dans d’autres maladies qui frappent l’humanitĂ© depuis des siècles. Ainsi, elle ouvre la voie Ă de nouveaux diagnostics et Ă de nouvelles solutions permettant d’attĂ©nuer la rĂ©sistance aux antibiotiques.
« Transmis par l’eau, le choléra est une maladie dévastatrice qui touche des millions de personnes et cause des milliers de décès chaque année. Et on s’attend à ce que les changements climatiques fassent empirer la situation. La résistance aux antibiotiques est aussi de plus en plus inquiétante, et il faut réfléchir à d’autres traitements anti-infectieux », explique le Pr Shapiro.
Une prédation efficace
ł˘â€™Ă©tłÜ»ĺ±đ prĂ©sente le concept de « prĂ©dation efficace ». Les scientifiques ont constatĂ© qu’un ratio plus Ă©levĂ© entre les phages prĂ©dateurs et leurs proies bactĂ©riennes Ă©tait associĂ© Ă des cas moins graves de cholĂ©ra. L’équipe dit ĂŞtre la première Ă montrer le fondement gĂ©nĂ©tique de ce ratio.
En outre, ce ratio peut s’avérer utile pour les médecins au moment de décider d’un traitement en les aidant à déterminer la gravité de la maladie. Il pourrait également permettre de prédire la progression de la maladie.
Les scientifiques ont utilisé des techniques génomiques de pointe pour analyser les interactions entre la bactérie et les bactériophages dans 2 574 échantillons de selles prélevés chez des personnes atteintes du choléra au Bangladesh, l’un des pays les plus touchés par cette maladie (environ 100 000 cas par année). Les échantillons ont été prélevés en 2018 et en 2019.
Le Pr Shapiro a menĂ© une analyse gĂ©nĂ©tique d’échantillons avec NaĂŻma Madi, Ph. D., auteure principale de l’étude et chercheuse postdoctorale Ă l’UniversitĂ© 69ČČĘÓƵ.
La cueillette de données sur la course aux armements génétiques entre la bactérie et les phages est une quête difficile, ce qui complique l’étude du choléra et de la biologie des phages. Chaque organisme évolue pour tenter de percer la défense de l’autre. Quand l’un s’adapte, l’autre riposte. Lorsque les phages ont le dessus, la diversité génétique bactérienne augmente. Puis, la population des phages chute. Finalement, le virus s’adapte sur le plan génétique et parvient à prospérer de nouveau.
Le Pr Shapiro prĂ©cise que davantage d’études, y compris un essai clinique, seront nĂ©cessaires avant que des traitements efficaces Ă base de phages soient mis au point. ł˘â€™Ă©tłÜ»ĺ±đ a reçu un soutien financier des National Institutes of Health et du programme de subventions Projet des Instituts de recherche en santĂ© du Canada, notamment.
ł˘â€™Ă©tłÜ»ĺ±đ
L’article « », par Naïma Madi, Jesse Shapiro et coll., a été publié dans Science.